对于男性来讲，跷二郎腿导致的局部温度上升确实可能影响生殖健康。精子生存的最适宜温度为35度左右，低于腹腔内部温度（37～38度），这也是人类的阴囊之所以悬吊于腹腔之外的原因。当温度升高到37～38度时，精子的活力会大大降低，甚至可能导致不育症。先天性隐睾症（睾丸停留在腹腔，未下降至阴囊）患者不育也正是因为如此。
另外，跷二郎腿可能会对前列腺造成不良影响，导致前列腺炎。前列腺所分泌的前列腺液是精液中的主要成分。正常分泌的前列腺液对保障精子活性和授精能力非常重要。如果长时间跷二郎腿，会阴部的压力增加，前列腺的血运受到明显影响，分泌功能会下降；同时阴部、尿道口部位的温度增高，有利于细菌繁殖，逆行性感染前列腺，从而发生前列腺炎。前列腺炎是很多男性雄风不再的原因。
对于女性，跷二郎腿不会引起像男性那样的问题，若没有如感染之类的妇科问题，不会影响生殖功能。
